Các biến chứng đường tiêu hóa thường gặp sau khi ghép thận, và chúng có phổ lâm sàng rộng, thay đổi từ tiêu chảy đến bệnh viêm ruột sau ghép thận (IBD). Ức chế miễn dịch mãn tính có thể làm tăng nguy cơ nhiễm trùng sau ghép và chấn thương liên quan đến thuốc và cũng có thể là nguyên nhân gây ra bệnh viêm ruột ở những người tái ghép thận mặc dù đã ức chế miễn dịch.