Phân biệt tế bào gốc phôi và tế bào gốc nhân tạo là rất quan trọng trong nghiên cứu cũng như ứng dụng y học . Tế bào gốc phôi, được lấy từ phôi thai, có khả năng phát triển thành các loại tế bào trong cơ thể, nhưng thường gặp tranh cãi về mặt đạo đức và pháp lý khi sử dụng. Ngược lại, tế bào gốc nhân tạo, như tế bào gốc vạn năng cảm ứng (iPSC), được sản xuất từ tế bào trưởng thành bằng cách tái lập trình chúng để có khả năng đa năng tương tự tế bào gốc phôi.