Trước khi thực hiện nội soi người bệnh cần sử dụng thuốc làm sạch đại tràng. Việc này sẽ giúp cho đại tràng được vệ sinh sạch sẽ và hỗ trợ công tác nội soi được thuận lợi cũng như chẩn đoán bệnh chính xác.