ThS. BS Nguyễn Xuân Mười có nhiều năm kinh nghiệm về chuyên ngành nội soi chẩn đoán và can thiệp. 

Ông là một trong những bác sĩ đã triển khai và áp dụng thành công hầu hết các loại kỹ thuật can thiệp nội soi điều trị các bệnh lý Nội khoa tiêu hóa như Nội soi can thiệp cầm máu, nội soi cắt niêm mạc và hạ niêm mạc ung thư sớm đường tiêu hóa, nội soi cắt cơ thắt dưới thực quản điều trị co thắt tâm vị, nội soi cắt u cơ trơn lành tính thực quản, mở thông dạ dày qua nội soi, nong và đặt stent chỗ hẹp đường tiêu hóa, siêu âm nội soi chẩn đoán và can thiệp. 

Đặc biệt, trong lĩnh vực điều trị ung thư sớm đường tiêu hóa, ông đã có kinh nghiêm trên 100 ca trong đó ESD dạ dày; trên 50 ca ESD thực quản và khoảng 100 ca ESD đại trực tràng.

Ông là người chủ trì đề tài đầu tiên về điều trị nội soi cắt tổn thương loạn sản và ung thư sớm dạ dày. Ngoài ra, ông đã và đang tham gia trực tiếp 2 đề tài điều trị nội soi ung thư sớm thực quản và ung thư sớm thực quản. Ông đã tham gia giảng dạy đào tạo về nội soi chẩn đoán, nội soi can thiệp đường tiêu hóa trên, đường tiêu hóa dưới. Tham gia viết sách nội soi can thiệp, tham gia dịch Atlas nội soi tiêu hóa.

Hiện tại, ThS. BS Nguyễn Xuân Mười đang giữ chức vụ là Trưởng khoa Nội soi can thiệp - Trung tâm Tiêu hóa - Gan mật - Tiết niệu, Bệnh viện Đa khoa Quốc tế Vinmec Times City.