Chuyên gia về phẫu thuật tiêu hóa, thực hiện thành công hơn 1000 ca phẫu thuật nội soi điều trị ung thư đại trực tràng, hơn 1000 ca phẫu thuật nội soi điều trị ung thư thực quản, hơn 500 ca phẫu thuật nội soi cắt dạ dày bán phần và toàn phần.

PGS.TS. BS Thầy thuốc nhân dân  - Phạm Đức Huấn là một trong những phẫu thuật viên tiên phong đã triển khai và áp dụng thành công hầu hết các loại phẫu thuật nội soi điều trị các bệnh lý Ngoại khoa tiêu hóa như Phẫu thuật nội soi cắt ung thư thực quản, Phẫu thuật nội soi cắt u lành thực quản, phẫu thuật nội soi điều trị co thắt tâm vị, phẫu thuật nội soi cắt dạ dày toàn bộ, cắt dạ dày bán phần, phẫu thuật nội soi cắt thận đuôi tụy, phẫu thuật nội soi cắt đại tràng, cắt trực tràng và điều trị nhiều bệnh lý Ngoại khoa ổ bụng khác. PGS Phạm Đức Huấn còn là chuyên gia phẫu thuật các bệnh lý hậu môn trực tràng, là người đầu tiên triển khai phẫu thuật Longo điều trị bệnh trĩ tại Việt Nam.

PGS.TS. BS Thầy thuốc nhân dân - Phạm Đức Huấn nguyên là Giám đốc Bệnh viện Đại học Y Hà Nội, nguyên Trưởng khoa phẫu thuật tiêu hóa Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức, nguyên Trưởng khoa Ngoại tổng hợp Bệnh viện Đại học Y Hà Nội. Ông nhận học hàm Phó Giáo sư năm 2007; đồng thời, ông cũng là thành viên của Hội Ngoại khoa và Hội phẫu thuật nội soi Việt Nam, Hội Hậu môn- Trực Tràng Việt Nam, Phó Tổng biên tập Tạp chí Phẫu thuật nội soi Việt Nam.

 PGS.TS. BS Thầy thuốc nhân dân - Phạm Đức Huấn là đồng chủ trì 1 đề tài khoa học quốc gia, chủ trì 2 đề tài nhánh cấp quốc gia, có trên 70 đề tài nghiên cứu khoa học được đăng trên các tạp chí khoa học uy tín trong nước và báo cáo tại các hội nghị khoa học chuyên ngành và 6 bài báo đăng tại các tạp chí khoa học quốc tế. PGS.TS.BS Phạm Đức Huấn còn là đồng chủ biên của 5 sách giáo khoa đào tạo Bác sĩ đa khoa, 1 sách giáo khoa đào tạo sau đại học, tham gia biên soạn 5 sách giáo khoa, giáo trình đại học và sau đại học. Trong đó, PGS Phạm Đức Huấn là chủ biên của cuốn sách "Bệnh học Ngoại khoa tiêu hóa" giảng dạy sau đại học đạt giải thưởng sách quốc gia.

Với những đóng góp cho sự nghiệp chăm sóc sức khỏe nhân dân, đào tạo và nghiên cứu khoa học, PGS Phạm Đức Huấn đã được tặng thưởng nhiều danh hiệu cao quý như danh hiệu Thầy thuốc nhân dân, danh hiệu Thầy thuốc Ưu tú, Huân chương lao động hạng Ba, Huân chương lao động hạng Hai, Chiến sĩ thi đua cấp Bộ.