Sốt kéo dài do nấm là do tác nhân nấm gây nên. Sốt kéo dài do nấm thường diễn ra nhiều tuần, trong một số trường hợp kéo dài đến hàng tháng. Sốt kéo dài do nấm có thể là do nhiễm khuẩn huyết do nấm candida albicans hoặc do Torulose.

Sốt kéo dài do nhiễm khuẩn ổ mủ sâu là một trong những nguyên nhân phổ biến của sốt kéo dài. Ổ mủ nhiễm khuẩn có khi rất khó để phát hiện, ổ càng sâu thì cần càng phải kiểm tra nhiều lần và thật kỹ lưỡng để có chẩn đoán và điều trị thích hợp.